设计引物的网页软件（在线设计引物的软件）
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引物的设计软件
1、primer5，primer6，primer express，beacon design，perlprimer，还有在线的网站。
2、选择上方的红蓝双向箭头的按钮进行引物设计，在设计开始前可以更改设计的参数，包括搜索的碱基范围、引物的长度，碱基数，设计结果显示的引物对数等。设置完参数后，点击下方的Search，软件开始分析设计，完成后，点击OK。
3、PrimerExpress0是ABI公司开发的一款用于荧光定量PCR引物探针的设计，也是此类软件中最广泛使用的软件之一。但是，PrimerExpress0在XP系统中使用正常，而在Windows7中则会出现无法使用的问题。下面的方法可以解决这一问题。
4、Primer Premier软件的主要功能分四种，即引物设计、限制性内切酶位点分析、DNA基元（motif）查找和同源性分析功能。前三种为其主要功能。
5、NoePrimer 03 独特的引物设计软件 Primer Premier 0 DEMO 序列分析与引物设计，非常棒的一个软件。Oligo 36 Demo 引物设计分析著名软件，主要应用于核酸序列引物分析设计软件。
引物设计的、软件有哪些?有什么优点和缺点?
1、这里简单说一下这三大设计软件的特点：Oligo：对引物的分析功能十分强大，包括引物发卡结构，引物二聚体，Tm值和非特异性结合等等都能进行全面的的分析，并能生成详细的报告。
2、优点：操作简单。缺点：不能保存分析结果。Primer0软件优点：操作简单、显示各种参数的改变和可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等。缺点：不能保存分析结果，只能选择打印。
3、之前NCBI上有一个probe选项可以直接设计引物，上面会给出上下游序列。
primer5设计引物怎么修改tm
1、点击File下拉菜单，选择New，然后选择DNASequence 从word文件中copy目标序列，然后control+V到primer5的文本框中，选择Asis，点击OK。
2、Tm在50-60，GC%在35-50其实都可以。重要的数据是，你的false priming的预测如何，就是预测的错配概率是多少。另外是否有茎环结构，引物二聚体概率多少，这些是关键数据。你用软件预测一下，都是可以算的。
3、引物长度，20bp；Tm值可以设置在55度（实验的时候可以用60度退火）；产物长度，100-150bp（如果没有合适的引物，产物长度可以设置在80-200）。
4、做Real Time时，用于SYBR Green I法时的一对引物与一般PCR的引物，在引物设计上所要求的参数是不同的。引物设计的要求：1）避免重复碱基，尤其是G.2）Tm=58-60度。
5、正常primer5设计引物时，Tm在40~70之间都没有问题，基本在PCR时候按照引物合成公司给的TM值进行试验，都没有问题！除非你的引物设计的有问题。
